Category Archives: splošno

Vabljeni na predavanje prof. Aharona Orena z naslovom “Red, extremely halophilic, but not archaeal: The biology of Salinibacter ruber” (13.2.2014 ob 15h v B1)

Vljudno vabljeni na predavanje prof. Aharona Orena (Department of Plant and Environmental Sciences, The Institute of Life Sciences, The Hebrew University of Jerusalem, Israel), ki bo v četrtek 13.2.2014 ob 15h v B1 (Biološko središče, Večna pot 111, Ljubljana).

Naslov predavanja: Red, extremely halophilic, but not archaeal: The biology of Salinibacter ruber.

Povzetek: Red halophilic Archaea of the family Halobacteriaceae dominate the prokaryote communities of saltern crystallizer ponds world-wide. However, culture-independent studies based on sequencing of environmental 16S rRNA sequences made it clear that an organism phylogenetically affiliated with the Bacteroidetes branch of the bacterial domain is quantitatively important in the same ecosystems. The organism was isolated and was described in 2002 as Salinibacter ruber. Salinibacter grows between 20 and 30% salt, and is unable to grow below a salinity of 15%. Its red pigment (salinixanthin) was identified as a novel acylated C40-carotenoid glycoside. A retinal proton pump (xanthorhodopsin) is present as well, and salinixanthin acts as a light antenna for the retinal protein. The membrane contains unique sulfonolipids. Although belonging to the bacterial domain, Salinibacter shares many characteristic properties with the extremely halophilic Archaea such as a high requirement for chloride for growth, accumulation of KCl to provide osmotic balance, the possession of a large excess of acidic amino acids in its cellular proteins, and the virtual absence of organic osmotic solutes. Many of the enzymes tested depend on high salt concentrations for activity. Comparison of the Salinibacter genome with the genomes of the halophilic Archaea shows how two groups of phylogenetically unrelated organisms maintain a similar life style and are adapted to life in salt-saturated brines.

 

(organizira prof. dr. Nina Gunde – Cimerman)

Vljudno vabljeni na predavanje “Cooperation and competition in microbial communities”; predavatelj: Kevin Foster; 20.1.2014

Vljudno vabljeni na predavanje “Cooperation and competition in microbial communities”, predaval bo prof. dr. Kevin Foster (Department of Zoology, University of Oxford, UK). Predavanje bo potekalo v ponedeljek, 20. 1. 2014 ob 9:00h v predavalnici B5, Biološko središče, Večna pot 111, Biotehniška fakulteta, UL.

Povezava na Fosterjev laboratorij, kjer dobite dodatne informacije o njegovem raziskovalnem delu: http://zoo-kfoster.zoo.ox.ac.uk/

Vabi Prof. Mandić-Mulec, Katedra za mikrobiologijo- Biotehniška fakulteta in Slovensko mikrobiološko društvo.

Vabilo na predavanje “Social interactions in complex microbial communities – Survival of the fittest or the friendliest?”

 Vljudno vabljeni na predavanje “Social interactions in complex microbial communities – Survival of the fittest or the friendliest?” predavatelja prof.  Søren J. Sørensen (Section of Microbiology, Department of Biology, University of Copenhagen)

Predavanje bo v četrtek, 19.9. 2013 ob 13:00 v predavalnici B5, Biološko središče, Večna pot 111.

POVZETEK PREDAVANJA:

Multispecies biofilms are predominant in almost all natural environments, setting the scene for various competitive and cooperative interactions that affect overall functionality and fitness of the individual strains and the community.

We have developed a model defining synergism, antagonism and neutrality within multispecies biofilms, based on the proportion of the species that are present and their ability to form monospecies biofilm. The model was validated experimentally in control systems of isogenic strains differing only in their ability of biofilm formation as single species. We applied this model to characterize the interactions in multispecies biofilm formation of bacterial consortia isolated from a variety of natural habitats.

Furthermore we have developed a simple assay for screening of antagonistic interactions among bacterial isolates. This approach was used to investigate the number of antagonistic interactions among bacteria co-isolated from the same environmental sample in comparison to interactions between isolates from different environments.

Recent research has revealed that bacterial plasmids and biofilm formation are interconnected in many ways. Horizontal transfer rates are typically higher in biofilm communities compared with those in planktonic states. Biofilms, furthermore, promote plasmid stability and may enhance the host range of mobile genetic elements that are transferred horizontally. Plasmids, on the other hand, are very well suited to promote the evolution of social traits such as biofilm formation. This, essentially, transpires because plasmids are independent replicons that enhance their own success by promoting inter-bacterial interactions. They typically also carry genes that heighten their hosts’ direct fitness. I present a couple of examples from our most recent research of how plasmids can promote biofilm formation in natural environments and reveal some of the molecular mechanisms behind this phenomenon.

In conclusion, we present results indicating ubiquity of synergism in multispecies biofilm formation in complex bacterial communities.

Vabilo na predavanje »Nevrocisticerkoza – več kot zapostavljena bolezen«, predava prof. dr. Ana Flisser; 9.9. 2013

Vljudno vabljeni na predavanje prof. dr. Ane Flisser z naslovom »Nevrocisticerkoza – več kot zapostavljena bolezen«, ki se bo v ponedeljek, 9. septembra 2013, pričelo ob 14.00 uri in bo potekalo v mali predavalnici Medicinske fakultete v Ljubljani.

Nevrocisticerkoza je ena izmed zapostavljenih parazitskih bolezni, ki jo pri človeku povzročajo ličinke svinjske trakulje Taenia solium. Je najpogostejša parazitska okužba osrednjega živčevja in glavni vzrok pridobljene epilepsije. Endemična je v večini razvijajočih se držav Azije, Latinske Amerike ter srednje in južne Afrike. Vse pogosteje o njej poročajo tudi v razvitih državah, predvsem zaradi povečanega priseljevanja bolnikov, okuženih s T. solium, in pogostega potovanja turistov v endemične kraje. V posameznih primerih se pojavlja tudi pri nas. Prof. dr. Ana Flisser je profesorica in raziskovalka na Nacionalni mehiški univerzi (Universidad Nacional Autónoma de México), ki svoje raziskovalno delo posveča (nevro)cisticerkozi in teniozi. Je avtorica številnih mednarodno odmevnih člankov in predsednica XIII mednarodnega parazitološkega kongresa (XIII International Congress of Parasitology – ICOPA XIII), ki bo prihodnje leto v Mehiki. V okviru svojega predavanja bo predstavila tudi ta kongres.

Vljudno vabljeni!

Vabilo na strokovno srečanje Sekcije za klinično mikrobiologijo in bolnišnične okužbe 4. Likarjev simpozij

Spoštovane članice in člani Slovenskega mikrobiološkega društva!
Vljudno vas vabimo na strokovno srečanje Sekcije za klinično mikrobiologijo in bolnišnične okužbe 4. Likarjev simpozij, ki bo namenjeno uvedbi evropskih standardov EUCAST, ki jih bodo mikrobiološki laboratoriji v Sloveniji začeli uporabljati z začetkom leta 2013. Srečanju bo dal poseben pečat aktivni obisk “očeta” standarda EUCAST gospoda Gunnarja Kahlmetra, predsednika evropskega združenja za klinično mikrobiologijo in infekcijske bolezni ESCMID. Svoj pogled na pomembnost, uporabo in morebitne težave ter prihodnji razvoj standardov EUCAST bosta podala tudi ugledna gosta iz Španije (Dr. Rafael Cantón, predsednik usmerjevalnega odbora EUCAST) in Iva Butič, dr. med. iz Hrvaške, kjer so standard že uvedli.
Ker gre za zelo pomembne spremembe, ki se bodo dotikale tako specialistov infektologov kot kliničnih mikrobiologov, si želimo, da bi prehod izpeljali čim bolj tekoče in z vsemi potrebni informacijami. Temu bo namenjena tudi okrogla miza: Kaj se lahko naučimo iz uspehov in napak drugih: uvedba smernic EUCAST v Sloveniji!
Srečanje je brezplačno. Zaradi izdaje potrdila o udeležbi in organizacije kosila, prosimo za predhodno prijavo.

KLIK ZA PROGRAM
KLIK ZA PRIJAVNICO

Veselimo se snidenja in vas lepo pozdravljamo,
Predsednik Sekcije za klinično mikrobiologijo in bolnišnične okužbe
Prof. dr. Miroslav Petrovec
Inšt. za mikrobiologijo in imunologijo
Zaloška 4
1000 Ljubljana
Tel: 015437451

Delavnica o molekularni filogenetiki, od ponedeljka 23. do srede 25. septembra 2013, Ljubljana

Kmetijski inštitut Slovenije bo v okviru projekta CropSustaIn (http://www.cropsustain.si) v sodelovanju z European Bioinformatics Institut (EMBL-EBI) iz Velike Britanije organiziral praktično delavnico z naslovom Molecular Phylogenetics. Udeleženci se bodo seznanili s programskimi orodji za molekularne študije, se naučili konstruirati in interpretirati filogenetska drevesa ter testirati evolucijske hipoteze.

Kdaj? Od ponedeljka 23. do srede 25. septembra 2013

Kje? Predvidoma v računalniški učilnici na Biotehniški fakulteti v Ljubljani, Jamnikarjeva ulica 101, Ljubljana.

Informacije o programu: http://www.ebi.ac.uk/training/course/molecular-phylogenetics-slovenia

Delavnica bo v angleškem jeziku. Število mest je omejeno. Udeležba po principu prijav do zasedbe prostih mest.

Kotizacije ni.

Prijave: Prijavite se tako, da izpolnite formular (http://www.cropsustain.si) in ga do 16. aprila 2013 pošljete na barbara.geric@kis.si. O izboru boste obveščeni po e-pošti do 7. maja 2013.

Molecular Phylogenetics Workshop, Monday to Wednesday, 23 to 25 September 2013, Ljubljana http://www.cropsustain.si

Vabilo na Občni zbor SMD s predavanjem “Respiratorni virusi – od prehlada do pljučnice”, 09. april. 2013

Vabimo vas, da se 09. aprila 2013 udeležite Občnega zbora SMD, ki se bo pričel ob 16.30 uri in bo potekal v prostorih sejne sobe dekanata BF.

KLIK za vabilo na OZ SMD (pdf)

V okviru Občnega zbora bo organizirano tudi predavanje “Respiratorni virusi – od prehlada do pljučnice” predaval bo Prof.dr. Miroslav Petrovec, dr.med.

Predstavitev teme predavanja: V zadnjih 15 letih smo v mikrobiologiji priča številnim odkritjem na področju virusov, ki povzročajo okužbe dihal pri človeku. V tem času so se pojavili nekateri povsem novi virusi, za nekatere prej znane pa je postalo jasno, da niso le nedolžni virusi prehlada, ampak povzročitelji resnih, življenje ogrožujočih okužb. Kako se s temi odkritji sooča klinični mikrobiolog pri diagnostiki virusnih okužb dihal in kaj to pomeni za zdravljenje in obravnavo bolnikov, bo v kratki predstavitvi povedal prof. dr. Miroslav Petrovec, vodja laboratorija za diagnostiko virusnih okužb na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo, Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani.